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此事底定后，便是要商量出使的人選，鴻臚寺根本沒有懂歐洲語言的人，所以在徐光啟的推薦下，王征便成為了鴻臚寺左少卿，帶領翻譯學校的一批學生去了歐洲，當然，在此之前，錦衣衛已經將所有去歐洲的學生征召成了錦衣衛小旗了。

大明使團在葡萄牙受到了熱烈的歡迎，在亞洲葡萄牙人是與大明關系最好的國家，現在澳門大多都是葡萄牙商人，而葡萄牙人更是將在印度的果阿等地交給了大明，雙方現在的關系可以說是正處于蜜月期。

歷史在這里稍微發生了一些變化，大明在亞洲與西班牙人的戰爭，使得西班牙的勢力受到了一定的損失，而葡萄牙人則借此機會開展了復國運動，于天啟十五年時終于獲得了獨立，和原來的歷史相比，提前了幾年時間。

大明使團受到了葡萄牙國王的接見，王征請求葡萄牙國王允許大明學生在這里求學，國王慷慨地答應了王征的要求，愿意負擔留在葡萄牙的五名學生的一切費用，并且賜給他們葡萄牙人身份，進入里斯本的學校進行學習。

短暫的停留后，大明使團進入地中海，來到了羅馬教廷。在隨行的傳教士的幫助下，王征以信徒的身份得到了教皇的接見，他把朱由校所寫的一封信交給了教皇。

朱由校在信中以謙卑的態度表示了對教皇的尊敬，并且要求教廷派出更多的傳教士前往大明進行傳教工作，這都讓教皇非常高興。但是朱由校又提出，因為大明的情況不同，所以天主教里的某些教義要進行一定程度的修改，比如祭祖祭孔的必要性，應該全面允許，并且要用文字固定下來。他還要求允許大明的教職人員自行任命各級教士，當然，紅衣主教的任命權還是在教皇手上。朱由校要求將王征封為紅衣主教，成為大明教區的最高級教士。

教皇用最大的毅力克制自己，才沒有把這封用漢語和拉丁文寫成的信當場撕掉。祭祖祭孔的事已經爭論了很長時間，最后教廷等于是默許了，所以這個倒是沒有什么問題。但朱由校說紅衣主教的任命權在教皇手中，卻直接要求封王征為紅衣主教，其意思很明顯，教皇只是相當于一個圖章，而且是大明說蓋你就要蓋的圖章。

什么時候一個國家的皇帝竟然可以對教廷的事指手劃腳了，而且這個皇帝還不是信徒。如果任其發展下去，最后大明的天主教只怕就不會再受教廷的控制了，這是不能允許的。但是這個國家可是有一萬萬人口，而且他們中的大多數還沒有一個堅定的宗教，這對于推廣天主教是一個多么大的誘惑呀。

更重要的是，這個國家的皇帝權力太大，可以說完全沒有人可以制約他，如果自己真的撕掉這封信，可以預見，天主教在這個東方大國的傳播一定會被強行喝止，這絕對不是教皇愿意看到的情形，一定要慎重，不要太情緒化。

于是教皇溫言地和王征談論了很長時間，然后召集了教廷的上層開會，討論大明皇帝的來信。果不其然，祭祖祭孔的事倒是沒有激怒主教們，但可以自行任命教職人員，強迫要求封王征為紅衣主教的要求遭到了大家的一致反對。基督教經過了多次分裂，主教們可不想再一次看到這種情況發生。

但是教皇提出的一萬萬潛在教徒確實吸引了主教們，以前的傳教士的報告寫得很清楚，大明的皇帝對于傳教并沒有明顯的歡迎或者抵觸，反而是官員們多有反對，南京教案便是一個例子。大明皇帝對于國內具有完全的控制力，這是歐洲各國的君主不能比擬的。如果交惡了大明皇帝，基督教根本沒有辦法在大明進行傳播。

經過兩天的討論，最后教廷終于屈服了。同意大明可以任命教職人員，但紅衣主教的任命權只能在教皇手中。至于王征，因為他本身便是大明的虔誠教徒，而且身份是大明的五品官員，所以教皇捏著鼻子任命他為大明區的紅衣主教。