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大明原來的武臣爵位制、散階、鎮戍營制、衛所營制、五軍都督府各級官職全部撤銷，對應配上新的爵位、散階、軍職、營制。

新的勛位、散階、軍職、營制通過眾人的集思廣益，幾天時間就差不多制定好了，這是一個涉及京師和地方七八個省的大工程，在清兵南下前完成是不可能的，現在只是起個頭，預計花兩到三年完成對整個南方的營兵改制。

現在主要是針對江北和湖廣等抗清前線的軍隊進行改制。在規范行伍，整肅軍紀、淘汰老弱的同時，新制充分考慮到了前線軍將和軍士的利益，對于御營、湖廣左鎮余部、江北四鎮余部三大主力，新制需要保證他們中大部分軍將能升官加俸，留在營中的軍士能有個體面的收入待遇，外加足夠的可晉升空間，以提高他們抗清的積極性。

至于南方各省鎮兵的改制暫時只停留在草案中，預計兩到三年完成。

在草案中，浙江和福建兩省，預設閩浙總督一人，駐杭州，標兵分兩營，設參將、游擊若干人分統，督標不超過六千人馬，配備相應騾馬。

另在浙江單設浙江巡撫一人，撫標兩營，仍設參將、游擊等若干領之。設提督一人，提標兩營。設定海、衢州兩鎮總兵，鎮標各兩營。

錢塘、臺州、衢州，各設水師左右路總兵，鎮標各一營，諭令浙江地方官即刻造船，打造大木暴曬，以備造船之用。

衢州、湖州、嘉興、紹興等七府城，各設一參將，各領一營，平時練兵，彈壓巡警地方。

預計浙江全省正額兵員三萬六千余員，余者全部給二十兩銀，五石米的遣散費，遣散裁撤。遣散費統一由朝廷一次性撥給，并派遣御營鎮撫、督軍和監察御史到各省聯合監督執行。確保遣散費能夠分到士卒手上和整編行伍工作的進行。

新制里總督督標、巡撫撫標，提督提標、總兵鎮標，都算是一省的機動力量。而分守分府各城的參將、游擊，則各領兵馬分別按道路，河流，分卡設警，同時駐防城中，警備非常。

有盜匪，水匪等警，有時是一路，一訊，各駐把總官，領額兵百余員，就地可以彈壓。而一旦遇到大股匪徒，或是流賊，就出動協標，鎮標，直到總督的督標。按警訊大小，分級出動官兵，予以平叛、鎮壓。層層設警，遇敵上報，出現任何遇賊不理，或是處置不利，一層一層的追查下去，責任分明，防區劃定，無可推脫。

對南方各省改制的目的一是裁軍節省糧餉，二是借改制，通過以文臣任總督、巡撫來節制統帥諸鎮武將，加強朝廷對地方武將的控制力。

浙江一省，地方州府原本報備到兵部的兵額有十幾萬之多，裁兵之后，不到四萬人，加輔兵長夫也不過六萬人，能大大減輕一下朝廷的財政壓力，足糧足餉之下，朝廷也能名正言順的用軍律來約束軍將和士卒了，而不復以前軍紀敗壞，將領各行其是，不聽指揮的窘迫情形了。

一番預計下來，浙江額兵三萬六千余人，福建三萬四千余人，云貴方面，除掉屯田兵、衛所兵外，額兵總兵在四萬人左右，四川已被張獻忠占領，暫時沒法改制，湖廣主力還是左良玉余部，南直隸由御營，京營防守，江北由四鎮余部負責防守。