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里人格真嗣對美里提到的信息，省略了使徒起源和第二次沖擊的很多細節。

生命之樹最終生出Adam(亞當)和Lilith(莉莉絲)。

亞當的老巢存在于的南極地下準球體空洞中，被稱為“白之月”。

40億年前莉莉絲隨一塊隕石撞擊地球，此為第一次沖擊，導致生物大滅絕，太平洋一側的地球物質被甩出，月球因此形成。

撞擊坑就是“黑之月”，即莉莉絲之卵，在當今NERV總部位置，這個球體空間跟亞當的白之月是一致的。

亞當及其使徒是地球原住民，而且亞當有個愛好就是種田——播撒生命之種，他用生命之樹的樹根作為勞動工具，開山劈地，辛苦種田幾億年，地球終于從石頭巖漿變得生機勃勃，他很有成就感。沒想到被莉莉絲的天地大沖撞滅絕了他的小生命，小弟使徒也被沖擊打回胚胎狀態陷入沉睡，當然氣得大暴走。

為爭奪地球霸主地位，兩者打得日月無光天地失色，亞當雖然戰斗力強悍但早在莉莉絲的沖擊中受了重傷，莉莉絲沒有生命之果雖然弱了些，橫渡星河也要靠月球這個大殼子保護自己，但勝在腦子聰明，力量運用更加靈活多變，好在亞當把生命之樹的樹根做成叉子當武器，挽回一點劣勢，不然莉莉絲早趁他病要他命了。

兩人勢均力敵，最后兩敗俱傷，亞當回到白之月長睡不起，沉睡前對各位小弟說，你們將來覺醒后跟我合體再去翻本。莉莉絲也被打得羊水破裂LCL流滿大地形成海洋，直到幾億年后NERV建好了還在繼續流。

為了尋求再生，莉莉絲向整個LCL海洋散播了自己的智慧種子，地球海洋再次充滿生命。源自智慧之果的催化因子能夠引導生物的進化方向，朝著智慧種族發展。

幾億年后，由古猿進化而來的智人出現了，其中最強的一支干掉了其他品種的智人同類，腳印迅速遍及全球。他們打破了亞當遵循的“物競天擇適者生存“的進化原則，貫徹了自己堅持的“智者生存”的概念，通過對工具的運用，獲得了遠勝于亞當制造的生命的競爭能力，并最終統治了地球。

持續通過LCL散播智慧，令莉莉絲也失去了全部能量，陷入了沉睡。

而得到了智慧的原始人類，則偶爾能從基因記憶里，得到一點點莉莉絲遺留的指點。這些指點，被人類先賢發掘、拼湊、整理出來，形成個各種散碎的神話傳說。

其中，比較完整流傳下來的記載就是《死海文書》，里面詳細記載并預言了使徒的起源和覺醒，以及“人類補完計劃”，就是全人類化為LCL靈魂回歸莉莉絲之卵，本質是莉莉絲收回力量的過程，卻被極端宗教組織SEELE稱為洗去原罪，獲得救贖的過程。

SEELE在德語中是“靈魂”的意思，經常被稱為“魂之座”。SEELE的高級成員一般并不直接露面，都是以聲音（）的形式出現的，其數目加上人類補完委員會的成員共計12名，中心人物是基路·洛倫茲議長。本部所在位置不明。的關系，就是靈魂與神經，適格者與插入栓的關系。這個極端宗教組織神秘并有很大權利，能調用世界上很多資金，甚至可以干涉聯合國事務，手中有《死海文書》，背后操縱整個人類。最終目的是實施“人類補完計劃”，其核心理念是“自我贖罪”。

SEELE認為現在的人類是罪惡的，讓人類都變橙汁(LCL之海，是一個沒有AT力場的世界。在這個世界，人類的意識無分彼此，所有人的靈魂都棲息于由莉莉斯的羊水構成的巨大海洋之內)，這個過程也正是向神贖罪。而且人類并不是單純的滅亡，而是轉化成新的形態，所有人合而為一，成為單一生命體。然而實際上是莉莉絲回收力量恢復實力的陰謀，所幸她失去太多力量導致意志湮滅，唯有靈魂不滅被注入凌波麗體內。

SEELE口中所謂的神，應該是指概念上的神，哲學神而不是指亞當或莉莉絲。因為他們對亞當和莉莉絲的所作所為完完全全是瀆神之舉。研究復制他們的肉.體，把亞當炸得四分五裂，甚至玩弄控制他們的靈魂，毫無敬畏之心。